C19/N – Varianti: aggiornamento (1)

Grafico del campionamento delle varianti e delle cladi al 17 dicembre 2021, da Nextstrain.

Archivio di Marco Poli Un appunto sui termini e le quantità : * i genomi del SARS-CoV-2 { ... [1][2][3] ... } campionati dal dicembre 2019 al 16 dicembre 2021 sono diverse migliaia, esattamente 3.548 [4]; * i genomi che condividono uno stesso insieme ereditario di mutazioni distintive sono raggruppati in ''varianti'', ognuna delle quali è suddivisa in ''cladi'' [5] o ''lignaggi'' [6] discendenti, termini mutuati da altri ambiti { [4][7][8] ... }; Cito : clade clade s. f. [dal lat. clades «distruzione, disastro, sconfitta»], letter. – Strage: E tra lor cominciar con fiera clade A tirar archi, e a menar lancie e spade (Ariosto); ne’ campi memori De la c. che ancora ulta non fu (Carducci). [5] lignàggio lignàggio (ant. legnàggio) s. m. [dal fr. ant. lignage, der. del lat. linea nel senso di «linea di discendenza»], letter. – 1. Stirpe, discendenza di famiglia illustre: un cavaliere, una dama d’alto l., d’antico l., di nobile l.; conoscendo lei non esser di legnaggio che alla sua nobiltà bene stesse (Boccaccio); trarre l., discendere o far risalire la propria origine: E trar volea da Troia il suo legnaggio (Caro). Anche stirpe in genere: il comune lignaggio A ognun d’essi dal volto traspar (Manzoni); Volgiti agli avi tuoi, guasto legnaggio (Leopardi); e con sign. estens.: Pianger l’aer e la terra e ’l mar devrebbe L’uman legnaggio (Petrarca), il genere umano, gli uomini. 2. In etnologia, gruppo esogamico di persone legate da un rapporto di discendenza unilineare (matrilineare o patrilineare) da un antenato o antenata comuni di cui si conserva il ricordo. [6] * le varianti funzionali e numericamente rilevanti che secondo l'OMS offrono motivi di interesse o di preoccupazione sono denominate usando le lettere dell'alfabeto greco [9][10], successivamente verranno usati i nomi delle costellazioni [11], e sono raggruppate in ''variants of interest'' ( VOI ) e ''variants of concern'' ( VOC ); oltre a queste, altre sono sotto monitoraggio e sono le ''variants under monitoring'' ( VUM ), ancora prive di etichetta alfabetica fino ad un riscontro certo e significativo su scala globale [12]. 1.1 Definizione di ''variant of interest'' ( VOI ) [12]: * una variante di SARS-CoV-2 con cambiamenti genetici previsti o noti per influenzare le caratteristiche del virus come trasmissibilità, gravità della malattia, fuga immunitaria, fuga diagnostica o terapeutica; E * identificata per causare una trasmissione significativa nella comunità o più cluster COVID-19, in più paesi con una prevalenza relativa crescente insieme a un numero crescente di casi nel tempo, o altri effetti epidemiologici apparenti per suggerire un rischio emergente per la salute pubblica globale. 1.2 Definizione di ''variant of concern'' ( VOC ) [12]: * una variante di SARS-CoV-2 che soddisfa la definizione di VOI ( vedi sopra ) e, attraverso una valutazione comparativa, ha dimostrato di essere associata a uno o più dei seguenti cambiamenti con un grado di rilevanza globale per la salute pubblica : ** aumento della trasmissibilità o cambiamento dannoso nell'epidemiologia di COVID-19; O ** Aumento della virulenza o cambiamento nella presentazione clinica della malattia; O ** Diminuzione dell'efficacia della sanità pubblica e delle misure sociali o della diagnostica disponibile, dei vaccini, delle terapie. 1.3 Definizione di ''variant under monitoring'' ( VUM ) [12]: * una variante di SARS-CoV-2 con cambiamenti genetici che si sospetta influenzino le caratteristiche del virus con qualche indicazione che potrebbe rappresentare un rischio futuro, ma le prove dell'impatto fenotipico o epidemiologico non sono attualmente chiare e richiedono un monitoraggio rafforzato e una valutazione ripetuta in attesa di nuove prove. 2 La celeberrima variante detta ''Delta'' ( B.1.617.2; G/478K.V1; 21A, 21I, 21J ) [13] è proliferata nel mondo grazie alla pressione selettiva agita dalla vaccinazione di massa ( in verde, nel grafico allegato ) siccome ''buca'' più spesso la copertura immunitaria conferita dal Sacro Vaccino [14]; in Italia ha superato il 90% della popolazione virale SARS-CoV-2 a luglio [15]. ( segue ) = Note [1] : ''Notizie'', Marco Poli, VK, 9 febbraio 2021, [ https://vk.com/wall170191717_1040 ]. [2] : ''Notizie'', Marco Poli, VK, 23 marzo 2021, [ https://vk.com/wall170191717_1209 ]. [3] : ''Notizie'', Marco Poli, VK, 11 agosto 2021, [ https://vk.com/wall170191717_1402 ]. [4] : ''Genomic epidemiology of novel coronavirus - Global subsampling'', Nextstrain, [ https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global ]. [5] : ''clade'', Vocabolario on line, Treccani, [ https://www.treccani.it/vocabolario/clade/ ]. [6] : ''lignàggio'', Vocabolario on line Treccani, [ https://www.treccani.it/vocabolario/lignaggio/ ]. [7] : ''PANGO Lineages: Latest epidemiological lineages of SARS-CoV-2'', CoV-Lineages, [ https://cov-lineages.org/index.html ]. [8] : ''Tracking of Variants'', GISAID, [ https://www.gisaid.org/hcov19-variants/ ]. [9] : ''WHO announces simple, easy-to-say labels for SARS-CoV-2 Variants of Interest and Concern'', WHO ( OMS ), 31 maggio 2021, [ https://www.who.int/news/item/31-05-2021-who-announces-simple-easy-to-say-labels-for-sars-cov-2-variants-of-interest-and-concern ]. [10] : ''Alfabeto greco'', Wikipedia, [ https://it.wikipedia.org/wiki/Alfabeto_greco ]. [11] : ''Variants could be named after star constellations when Greek alphabet runs out, says WHO Covid chief'', Sarah Newey, The Telegraph, 7 agosto 2021, [ https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/variants-could-named-star-constellations-greek-alphabet-runs/ ]. [12] : ''Tracking SARS-CoV-2 variants'', WHO ( OMS ), [ https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ ]. [13] : ''SARS-CoV-2 Delta variant'', AA. VV., Wikipedia, [ https://en.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV-2_Delta_variant ]. [14] : ''I vaccini sono meno efficaci contro la variante Delta rispetto a quella Alfa'', AGI, 23 ottobre 2021, [ https://www.agi.it/cronaca/news/2021-10-23/vaccini-meno-efficaci-contro-variante-delta-14300313/ ]. [15] : ''CS N°37/2021 - Covid-19: in Italia la ‘variante delta’ oltre il 90%, sostituita la ‘Alfa’'', ISS, 30 luglio 2021, [ https://www.iss.it/primo-piano/-/asset_publisher/3f4alMwzN1Z7/content/comunicato-stampa-n%25C2%25B037-2021-covid-19-in-italia-la-variante-delta-al-94-2%2525-sostituita-la-alfa- ]; { PDF } : [ https://www.iss.it/documents/20126/0/FLASH+SURVEY+Varianti_SARS-CoV-2_30luglio.pdf/6c1c9969-e62c-cf19-6d1e-d9679e21692a?t=1627647977533 ]. === Marco Poli aka Astio, Bufalo --- { prima pubblicazione del post su VK, il 18 dicembre 2021 [ 16 ]; su FB : [ 17 ] }.

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